Veja bem, na minha opinião existem dois tipos de dungeons:
1) Dungeons pela dungeon. 2) Dungeon pela história

Se na história faz sentido que os jogadores entrem em uma masmorra subterrânea, então você tem o caso 2. Mas muitos grupos preferem jogos "dungeon crawl", onde os personagens entram na dungeon em busca de poder e riquezas (os jogadores o fazem pela diversão e desafio), esse seria o caso 1.

O caso 2 é fácil. É só fazer uma dungeon que faça sentido.
Uma caverna de um dragão provavelmente vai possuir tuneis maiores, tesouros, será populada por servos do dragão e por criaturas subterrâneas.
Um laboratório subterrâneo de um mago por outro lado, possuiria armadilhas mágicas, seria guardado por golens, homunculus e elementais, além de possuir loot mágico (como poções e pergaminhos).
Uma fortaleza de asterios possuiria corredores labirínticos, soldados patrulhando cada esquina e muitas armas para serem roubadas.

Agora quando falamos do caso 1, a coisa fica diferente. Nesse caso 75% da aventura se passará dentro da dungeon, com o grupo só saindo para se reabastecer na cidade e coisas do tipo. Neste caso faria sentido que a dungeon fosse maior e que possuísse múltiplos níveis (talvez até que fosse impossível "limpá-la" numa tacada só, com os jogadores precisando limpar um andar por vez e reabastecer constantemente). Contar o número de rações, flechas e poções pode contribuir para o clima. Outra dica é adicionar NPCs racionais dentro da dungeon, assim os jogadores que curtem um role play terão o que fazer. Exemplos incluem: um misterioso mercador de itens mágicos, outro grupo de aventureiros que também está tentando limpar a dungeons, um homem com vida eterna destinado a proteger um artefato mágico, um homem amaldiçoado que morrerá instantaneamente se tentar subir um andar, servos da entidade criadora da dungeon que estão insatisfeitos com seu trabalho, etc...

São boas sacadas amigo, vou matutar sobre elas. Muito obrigado pela ajuda :)